Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc18Q640L5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc18Q640L5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc18Q640L5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc18Q640L5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
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