Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga3Q62470 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Itga3Q62470 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga3Q62470 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga3Q62470 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga3Q62470 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga3Q62470 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga3Q62470 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga3Q62470 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga3Q62470 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga3Q62470 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga3Q62470 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itga3Q62470 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga3Q62470 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga3Q62470 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga3Q62470 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga3Q62470 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga3Q62470 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga3Q62470 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms