Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vil1Q62468 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vil1Q62468 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms