Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20854Q62461 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20854Q62461 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms