Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl12Q62401 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl12Q62401 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms