Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spock1Q62288 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spock1Q62288 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spock1Q62288 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms