Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Six1Q62231 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Six1Q62231 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Six1Q62231 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms