Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctr9Q62018 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctr9Q62018 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms