Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itga6Q61739 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itga6Q61739 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itga6Q61739 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms