Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga7Q61738 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga7Q61738 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga7Q61738 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga7Q61738 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga7Q61738 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga7Q61738 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga7Q61738 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms