Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna11Q61716 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna11Q61716 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna11Q61716 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms