Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rad21Q61550 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rad21Q61550 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rad21Q61550 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms