Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lcp1Q61233 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lcp1Q61233 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lcp1Q61233 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms