Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gata6Q61169 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gata6Q61169 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gata6Q61169 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms