Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamb3Q61087 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamb3Q61087 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamb3Q61087 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms