Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf3Q60980 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf3Q60980 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf3Q60980 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms