Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rbbp7Q60973 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rbbp7Q60973 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rbbp7Q60973 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms