Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Grik1Q60934 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grik1Q60934 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grik1Q60934 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grik1Q60934 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms