Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Neurod1Q60867 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Neurod1Q60867 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Neurod1Q60867 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Neurod1Q60867 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Neurod1Q60867 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Neurod1Q60867 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Neurod1Q60867 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms