Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rasa3Q60790 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rasa3Q60790 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rasa3Q60790 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rasa3Q60790 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms