Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atf3Q60765 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atf3Q60765 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atf3Q60765 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atf3Q60765 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms