Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ItgaeQ60677 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ItgaeQ60677 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ItgaeQ60677 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms