Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uimc1Q5U5Q9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uimc1Q5U5Q9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uimc1Q5U5Q9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms