Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc5a6Q5U4D8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc5a6Q5U4D8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms