Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LpoQ5SW46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LpoQ5SW46 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LpoQ5SW46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms