Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mks1Q5SW45 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mks1Q5SW45 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mks1Q5SW45 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms