Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PfasQ5SUR0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PfasQ5SUR0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PfasQ5SUR0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms