Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam46cQ5SSF7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam46cQ5SSF7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Fam46cQ5SSF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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