Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps54Q5SPW0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps54Q5SPW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps54Q5SPW0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps54Q5SPW0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms