Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc85aQ5SP85 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc85aQ5SP85 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc85aQ5SP85 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85aQ5SP85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms