Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna2d4Q5RJF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna2d4Q5RJF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms