Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trdv4Q5R1A3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trdv4Q5R1A3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trdv4Q5R1A3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms