Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scarf1Q5ND28 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scarf1Q5ND28 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scarf1Q5ND28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scarf1Q5ND28 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms