Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dph1Q5NCQ5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dph1Q5NCQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dph1Q5NCQ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms