Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hs3st6Q5GFD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hs3st6Q5GFD5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hs3st6Q5GFD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms