Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1lQ5D525 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Syce1lQ5D525 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syce1lQ5D525 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms