Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufaf2Q59J78 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufaf2Q59J78 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufaf2Q59J78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms