Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CenpjQ569L8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CenpjQ569L8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CenpjQ569L8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CenpjQ569L8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1022.9 ms