Protein–RNA interactions for Protein: Q52KP5

Nxpe4, NXPE family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe4Q52KP5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nxpe4Q52KP5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe4Q52KP5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe4Q52KP5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms