Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Adamts18Q4VC17 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Adamts18Q4VC17 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Adamts18Q4VC17 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms