Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBE8

Wdr18, WD repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr18Q4VBE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr18Q4VBE8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Wdr18Q4VBE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Wdr18Q4VBE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms