Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms