Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-Q2Q4KN81 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2-Q2Q4KN81 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-Q2Q4KN81 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms