Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec4Q497M3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec4Q497M3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms