Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms