Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933416C03RikQ3V063 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933416C03RikQ3V063 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
4933416C03RikQ3V063 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933416C03RikQ3V063 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms