Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hipk4Q3V016 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hipk4Q3V016 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms