Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd3l2Q3UXB0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms