Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Clca4bQ3UW98 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms