Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm12888Q3UW77 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms