Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Capn13Q3UW68 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Capn13Q3UW68 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms